Quel est le délai de paiement de l’indemnité journalière CPAM ? Quels sont les délais moyens ? Et que faire en cas de retard ? Retrouvez dans cet article tout ce qu’il faut savoir sur les délais de versement des indemnités journalières.

En cas d’arrêt de travail pour raison médicale, les indemnités journalières (IJ) sont un soutien financier essentiel. Versées par la Caisse Primaire d’Assurance Maladie (CPAM) ou la Mutualité Sociale Agricole (MSA), elles compensent la perte de revenus.


Quel est le délai moyen de versement des indemnités journalières ?

Après l’application des jours de carence lors d’un arrêt maladie, les versements s’organisent selon un calendrier défini par les caisses.

 

Paiement des indemnités journalières tous les 14 jours (salariés et indépendants)

Pour les salariés affiliés au régime général, les indemnités journalières sont versées tous les 14 jours en moyenne, après 3 jours de carence. Ce rythme bimensuel permet une certaine régularité dans la prise en charge.

Exemple concret : Emma, salariée en CDI, est arrêtée pour maladie à partir du 1er juin. Après les 3 jours de carence (1er, 2 et 3 juin), elle commence à percevoir des indemnités journalières à partir du 4 juin. La CPAM lui verse une première indemnité autour du 18 juin, couvrant la période du 4 au 17 juin. Ensuite, elle reçoit un deuxième paiement début juillet, selon le rythme bimensuel habituel.

Voici une vidéo explicative de l’Assurance maladie :

Le calcul des indemnités journalières CPAM dépend du salaire brut des 3 derniers mois, avec un taux fixé à 50 % du salaire journalier de base, plafonné à 1,4 SMIC (depuis avril 2025). Vous pouvez estimer le montant que vous allez percevoir en utilisant le simulateur d’indemnités journalières maladie.

 

Délai moyen pour les exploitants agricoles (MSA)

La MSA applique aussi un rythme de versement toutes les deux semaines environ, après un délai de carence équivalent.

La durée de versement varie :

    • 360 jours sur 3 ans pour des arrêts de moins de 6 mois
    • Jusqu’à 3 ans en cas d’ALD ou arrêt prolongé

 

Comment suivre vos paiements d’indemnités journalières ?

Les personnes inscrites à la CPAM peuvent suivre précisément le traitement de votre dossier pour anticiper les versements ou détecter un retard.

 

Suivre ses indemnités journalières avec la CPAM

Vous pouvez consulter le suivi de vos IJ via votre compte ameli.fr dans la rubrique « Mes paiements ».

Votre espace personnel permet en effet de visualiser :

    • Les arrêts enregistrés
    • Les montants versés
    • Les dates de versement passées et futures

Cette rubrique vous informe également si un justificatif manque ou si un traitement est en cours.

 

Suivre ses IJ avec la MSA

Les affiliés MSA peuvent se connecter à leur compte “Mon espace privé” sur msa.fr et accéder au service de “consultation des paiements et décomptes santé”.

Vous y trouverez les dates de déclaration, les versements effectués au cours des 12 derniers mois et ceux à venir, ainsi qu’un suivi des justificatifs fournis ou attendus.

 

Retard des indemnités journalières : quels sont les motifs fréquents ?

Même si les caisses automatisent une grande partie du traitement, des retards peuvent survenir. Voici les raisons les plus courantes.

Retard lié à l’employeur ou au médecin

    • Attestation de salaire non transmise par l’employeur
    • Formulaire d’arrêt de travail incomplet ou mal rempli
    • Délais de transmission entre les services

Retard administratif

    • Dossier incomplet (ex : RIB, justificatif manquant)
    • Erreur dans les coordonnées bancaires
    • Changement de situation non déclaré

Retard exceptionnel

En période de forte activité (ex : épidémies, grèves), les services de l’Assurance Maladie et de la MSA peuvent accumuler du retard. Il est donc conseillé de vérifier régulièrement son espace personnel et de contacter la CPAM ou un conseiller MSA en cas de doute.

 

Qui contacter en cas de retard de paiement ?

En cas de délai anormalement long (plus de 20 jours après l’arrêt), voici les démarches recommandées :

    • Rapprochez-vous de votre employeur pour vérifier s’il a bien transmis l’attestation de salaire
    • Vérifier que le médecin a bien envoyé le volet 1 de l’arrêt à la CPAM ou MSA
    • Utiliser la messagerie sécurisée de votre compte Ameli ou MSA pour signaler le retard
    • Appeler le 3646 (CPAM) ou contacter votre antenne MSA locale

 

Questions fréquentes sur le délai de paiement de l’indemnité journalière CPAM

​Quel est le délai de paiement de l’indemnité journalière CPAM ?

Les indemnités sont en général versées tous les 14 jours après un délai de carence de 3 jours, à condition que l’attestation de salaire ait été transmise.

​Comment connaître la date de versement de mes IJ par la CPAM ?

Vous pouvez consulter votre espace personnel sur le site Ameli, rubrique “Mes paiements”. Les dates à venir y sont indiquées.

​Un arrêt de travail prolongé relance-t-il le délai de carence ?

Non, si l’arrêt est prolongé sans interruption ou après une reprise inférieure à 48h, le délai de carence ne s’applique pas une nouvelle fois.

​Les IJ sont-elles rétroactives en cas de retard administratif ?

Oui, même en cas de traitement tardif, les indemnités sont versées rétroactivement à partir du 4ème jour d’arrêt.


Crédit photo : © deniskomarov / Adobe


Dorothée rédactrice aide sociale

Journaliste/Rédactrice, je possède dix ans d’expériences professionnelles web et rédaction et travaille pour le site aide-sociale.fr depuis 2017. Ma connaissance fine des questions juridiques et du dispositif administratif et social en France me permet d’informer au mieux les lecteurs sur leurs droits et les démarches utiles en fonction de leur situation.

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